Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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