Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms