Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTBP1Q13363 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms