Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATMQ13315 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATMQ13315 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATMQ13315 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATMQ13315 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATMQ13315 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATMQ13315 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATMQ13315 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATMQ13315 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATMQ13315 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATMQ13315 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATMQ13315 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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