Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms