Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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