Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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