Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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NPRL3Q12980 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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NPRL3Q12980 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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NPRL3Q12980 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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NPRL3Q12980 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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NPRL3Q12980 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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NPRL3Q12980 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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NPRL3Q12980 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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NPRL3Q12980 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NPRL3Q12980 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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NPRL3Q12980 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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