Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms