Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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