Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms