Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269.7 ms