Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDR1Q08345 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms