Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms