Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms