Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LTBQ06643 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTBQ06643 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LTBQ06643 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms