Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX1T1Q06455 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms