Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms