Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms