Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms