Protein–RNA interactions for Protein: Q05823

RNASEL, 2-5A-dependent ribonuclease, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASELQ05823 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNASELQ05823 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms