Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms