Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms