Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms