Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms