Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTCQ00610 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms