Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms