Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL23P62829 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL23P62829 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL23P62829 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL23P62829 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL23P62829 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPL23P62829 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms