Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VBP1P61758 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VBP1P61758 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VBP1P61758 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VBP1P61758 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VBP1P61758 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VBP1P61758 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VBP1P61758 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VBP1P61758 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VBP1P61758 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VBP1P61758 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VBP1P61758 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms