Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms