Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP25P60880 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms