Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVPABLB-1P60509 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms