Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms