Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms