Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEMP55040 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GEMP55040 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEMP55040 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GEMP55040 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GEMP55040 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GEMP55040 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms