Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERFP50548 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERFP50548 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERFP50548 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms