Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPHP49418 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPHP49418 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPHP49418 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPHP49418 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPHP49418 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPHP49418 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPHP49418 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPHP49418 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPHP49418 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPHP49418 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMPHP49418 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMPHP49418 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMPHP49418 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMPHP49418 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPHP49418 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPHP49418 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPHP49418 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPHP49418 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPHP49418 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPHP49418 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPHP49418 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPHP49418 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPHP49418 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPHP49418 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPHP49418 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPHP49418 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPHP49418 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPHP49418 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPHP49418 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPHP49418 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPHP49418 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPHP49418 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMPHP49418 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms