Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms