Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX2P48431 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms