Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRXP46100 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRXP46100 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRXP46100 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRXP46100 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRXP46100 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRXP46100 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRXP46100 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRXP46100 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRXP46100 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRXP46100 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms