Protein–RNA interactions for Protein: P40259

CD79B, B-cell antigen receptor complex-associated protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD79BP40259 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD79BP40259 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD79BP40259 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD79BP40259 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD79BP40259 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD79BP40259 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD79BP40259 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD79BP40259 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD79BP40259 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD79BP40259 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD79BP40259 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD79BP40259 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD79BP40259 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD79BP40259 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD79BP40259 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD79BP40259 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD79BP40259 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD79BP40259 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD79BP40259 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms