Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms