Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF4P34130 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NTF4P34130 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms