Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AL139353.2-201ENST00000549844 699 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC093726.2-201ENST00000609134 679 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC079779.3-218ENST00000612487 940 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 RBBP4P3-201ENST00000619705 1283 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 OR4K1-202ENST00000641172 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 LINC01686-201ENST00000566297 1376 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC006378.1-201ENST00000426193 563 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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HOXD11P31277 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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HOXD11P31277 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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HOXD11P31277 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 LINC01888-202ENST00000457602 574 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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