Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMO2P25791 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMO2P25791 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMO2P25791 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMO2P25791 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMO2P25791 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMO2P25791 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMO2P25791 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMO2P25791 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO2P25791 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO2P25791 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO2P25791 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO2P25791 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO2P25791 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO2P25791 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO2P25791 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms