Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSSP25774 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSSP25774 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms