Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCR1P25024 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms