Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPREP23469 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPREP23469 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPREP23469 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPREP23469 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPREP23469 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPREP23469 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPREP23469 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPREP23469 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPREP23469 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPREP23469 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPREP23469 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPREP23469 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPREP23469 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPREP23469 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPREP23469 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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