Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MUC1P15941 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MUC1P15941 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MUC1P15941 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MUC1P15941 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MUC1P15941 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MUC1P15941 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC1P15941 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MUC1P15941 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MUC1P15941 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MUC1P15941 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MUC1P15941 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MUC1P15941 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MUC1P15941 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MUC1P15941 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MUC1P15941 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MUC1P15941 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MUC1P15941 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MUC1P15941 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MUC1P15941 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MUC1P15941 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MUC1P15941 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MUC1P15941 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MUC1P15941 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MUC1P15941 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MUC1P15941 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MUC1P15941 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MUC1P15941 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MUC1P15941 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MUC1P15941 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms