Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF35P13682 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms